Halo s'utilise pour les images en fond clair et/ou en fluorescence. Il permet de quantifier des aires d'intérêts, des marquages dans des comprtiments cellulaires (noyau, cytoplasme et membrane). On peut séparer des classes de tissus en utilisant l'approche de l'apprentissage par l'exemple. Il est aussi possible de calculer la distance moyenne entre 2 cellules ou population d'objets.
Amira est l'outil qui permet de reconstruire en 3D pour des analyses ultérieures telles que la mesure de volume, d'aires, d'objets. Les outils disponibles permettent à l'utilisateur d'effectuer des opérations d'amélioration de l'image, créer des flux de travail de segmentation simplifiés et automatisés, et effectuer des mesures et des tâches de quantification sur des objets dans l'image tels que des cellules, des os et d'autres caractéristiques des tissus.
De plus vous pouvez reconstruire votre image 3D à partir de coupes et aussi intégrer d'autres images de référence par exemple.
Segmentation, marquage et comptage automatiques des noyaux cellulaires
